Nobunaga yang terkenal karena kecerdasannya dan keberaniannya, menerima Kaito sebagai salah satu ninja-nya dan memberinya nama samurai "Gengorō". Kaito kemudian bergabung dengan pasukan ninja Nobunaga dan mulai bekerja sama dengan mereka untuk menghancurkan musuh-musuh Nobunaga.
Di Jepang pada abad ke-16, selama periode Sengoku, kekacauan dan peperangan terus-menerus meletus di seluruh negeri. Di tengah-tengah kekacauan ini, seorang ninja muda bernama Kaito muncul sebagai salah satu yang paling berbakat dan berani. nobunaga no shinobi sub indo top
Kaito yang merasa dendam dan bersalah, memutuskan untuk meninggalkan keluarganya dan mencari perlindungan di bawah pimpinan Oda Nobunaga, seorang daimyo (penguasa feodal) yang kuat dan ambisius. Di tengah-tengah kekacauan ini, seorang ninja muda bernama
Namun, ketika Kaito semakin dekat dengan Nobunaga dan anak buahnya, dia mulai menyadari bahwa ada sesuatu yang tidak beres dengan Nobunaga. Nobunaga yang terlihat seperti seorang pemimpin yang kuat dan bijak, ternyata memiliki sisi gelap yang tidak diketahui banyak orang. Nobunaga yang terlihat seperti seorang pemimpin yang kuat
Kaito harus menggunakan kemampuan ninja-nya untuk mengungkap rahasia-rahasia Nobunaga dan memilih antara kesetiaannya kepada Nobunaga dan keadilan yang sebenarnya.